Сейчас приходится либо перезаписывать файл ручками, либо производить настройку вручную.
Соответственно и на сервере предусмотреть изменение (загрузку) этого файла. Можно даже с галкой "Переслать всем клиентам" если на сервер заливается новый файл настроек клиента.